Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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