Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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