Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COX10Q12887 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms