Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPTFQ12830 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms