Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms