Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms