Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms