Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms