Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms