Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms