Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms