Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms