Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms