Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHC1P78364 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHC1P78364 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PHC1P78364 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms