Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms