Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ACTBP60709 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ACTBP60709 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ACTBP60709 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ACTBP60709 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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ACTBP60709 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ACTBP60709 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
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ACTBP60709 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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