Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP3P54852 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP3P54852 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms