Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms