Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms