Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA4P43681 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms