Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms