Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms