Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLDCP23378 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLDCP23378 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLDCP23378 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLDCP23378 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLDCP23378 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLDCP23378 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GLDCP23378 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLDCP23378 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLDCP23378 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLDCP23378 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLDCP23378 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms