Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms