Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms