Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DPA1P20036 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms