Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIG1P18858 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIG1P18858 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIG1P18858 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIG1P18858 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIG1P18858 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIG1P18858 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIG1P18858 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms