Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DESP17661 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DESP17661 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DESP17661 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms