Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMDP11532 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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