Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGAMP11215 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGAMP11215 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGAMP11215 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGAMP11215 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGAMP11215 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGAMP11215 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGAMP11215 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGAMP11215 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGAMP11215 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGAMP11215 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGAMP11215 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGAMP11215 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGAMP11215 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms