Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC172P0C7W6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms