Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
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