Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB1P08034 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB1P08034 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms