Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLR5O60602 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLR5O60602 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLR5O60602 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR5O60602 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms