Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms