Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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