Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TO15178 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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