Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BNH8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BNH8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BNH8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BNH8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BNH8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BNH8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BNH8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3BNH8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BNH8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BNH8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BNH8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3BNH8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3BNH8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms