Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms