Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms