Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms