Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms