Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms