Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms