Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms