Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC7AQ9ULT0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms