Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms