Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNIH4Q9P003 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNIH4Q9P003 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNIH4Q9P003 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNIH4Q9P003 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNIH4Q9P003 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNIH4Q9P003 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNIH4Q9P003 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNIH4Q9P003 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH4Q9P003 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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