Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms