Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms